Μηχανική και Δυναμική της πρωτεΐνης Chignolin
Στοιχεία Διπλωματικής
- Ακαδημαϊκό Έτος:
- 2025 - 2026
- Θεματική Ενότητα:
- Materials Science and Technology
- Επιβλέπων:
- Δασκαλάκης
- Υποχρεωτικό Μάθημα 1:
- Molecular Spectroscopy (CHM_E_B2)
- Υποχρεωτικό Μάθημα 2:
- Biomaterials (CHM_E_Γ3)
Ανάθεση Διπλωματικής
- Ονοματεπώνυμο Φοιτητή:
- ΑΝΔΡΕΑΣ ΓΟΥΣΓΟΥΝΕΛΛΗΣ (AM: 1095260)
Παρατηρήσεις
Το πολυπεπτίδιο chignolin, με μόλις 10 αμινοξικά κατάλοιπα (GYDPETGTWG), αναδιπλώνεται σε μια μοναδική δομή σε νερό αποτελώντας έναν ιδανικό στόχο για τη βελτιστοποίηση και ανάπτυξη υπολογιστικών τεχνικών (αλγόριθμων μηχανικής μάθησης, αλγόριθμων ενισχυμένης δειγματοληψίας). Στη διπλωματική αυτή θα χρησιμοποιήσουμε μεταλλάγματα της chignolin, ώστε να αναπτυχθεί μια μέθοδος ενισχυμένης δειγματοληψίας με εφαρμογές στο πλάισιο της Μοριακής Δυναμικής (Molecular Dynamics) και της αποδοτικότερης συλλογής διαμορφώσεων μεγαλύτερων πρωτεϊνών.