Πρόβλεψη λειτουργικών διαμορφώσεων διαμεμβρανικών μεταφορέων με τη χρήση εργαλείων μηχανικής μάθησης (AlphaFold, RoseTTAFold-RFDiffusion)

H διπλωματική αυτή αφορά στη χρήση εργαλείων πρόβλεψης δομής με μηχανική μάθηση (AlphaFold, RoseTTAFold-RFDiffusion) σε συνδυασμό με περιορισμένη δειγματοληψία Μοριακής Δυναμικής. Ο συνδυασμός θα οδηγήσει στην ενίσχυση της δειγματοληψίας αναφορικά με τις σημαντικότερες λειτουργικές διαμορφώσεις διαμεμβρανικών βιομορίων που συμμετέχουν στη μεταφορά μικρών μορίων δια μέσου βιολογικών μεμβρανών. Η διπλωματική σχετίζεται με ιατρικές και βιοτεχνολογικές εφαρμογές (π.χ. καταπολέμηση της αντίστασης ορισμένων βακτηρίων σε αντιβιοτικά ή του μεταβολισμού χημειοθεραπευτικών παραγόντων).